石狩湾新港地域の開発は、「第3期北海道総合計画」（昭和45年7月閣議決定）において、北海道開発の一大プロジェクトとして、道央圏における新たな流通と生産機能を分担する拠点港を目指し、本港の建設と背後地域の開発が決定されました。

石狩湾新港の建設は、「石狩湾新港地域開発基本計画」（昭和47年8月策定）において、道央圏における物資需要の増大に対処するとともに、日本海沿岸地域及び北方圏諸国等との経済交流の拠点としての役割を担い、北海道の長期的かつ飛躍的発展を先導する開発事業として位置づけられ、この基本計画を受け、昭和47年11月に石狩湾新港港湾計画を決定しました。

当初、北海道が単独で港湾管理者となり石狩湾新港の管理運営を行っていましたが、昭和48年4月、重要港湾の指定を受け、国直轄事業として本格的に港湾整備が始まったことなどから、石狩湾新港の建設と背後地域の開発をより有機的かつ強力に推し進めていくため、昭和53年4月から、北海道、小樽市及び石狩町（現石狩市）の三者による石狩湾新港管理組合が設立され、今日に至っています。