이시카리만 신항의 관리자는 1972년 10월부터 1978년 3월까지 홋카이도 단독으로 관리되어 왔지만, 1978년 4월 1일, 본 항만 지역에 근처한 오타루시와 이시카리쵸(현 이시카리시)가 공동관리자로 더해져, 홋카이도와 3자에 의한 이시카리 신항 관리조합(일부 사무조합)이 설립되어 오늘날에 이르고 있습니다.